4.60.5.4 Ensamblaje de Secuencias de ADN (4 horas) [Habilidades CS2]

Referencias Bibliográficas: [,] Tópicos
  1. Fundamento biológico: caso ideal, dificultades, métodos alternativos para secuenciamiento de ADN
  2. Modelos formales de ensamblaje: Shortest Common Superstring, Reconstruction, Multicontig
  3. Algoritmos para ensamblaje de secuencias: representación de overlaps, caminos para crear superstrings, algoritmo voraz, grafos acíclicos.
  4. Heurísticas para ensamblaje: búsqueda de sobreposiciones, ordenación de fragmentos, alineamientos y consenso.

Objetivos de Aprendizaje

  1. Comprender el desafío computacional que ofrece el problema de Ensamblaje de Secuencias. [Familiarizarse]
  2. Entender el principio de modelo formal para ensamblaje. [Evaluar]
  3. Conocer las principales heurísticas para el problema de ensambjale de secuencias ADN [Usar]



Generado por Ernesto Cuadros-Vargas , Sociedad Peruana de Computación-Peru, Universidad de Ingeniería y Tecnología, Lima-Perú
basado en el modelo de la Computing Curricula de IEEE-CS/ACM